生物学・生命科学・基礎医学

• The Generic Circumscription of Tetrapisispora Ueda-Nishinura et Mikata (1999) (Saccharomycetaceae): The Proposal of Nishimuraea gen. nov.

  Taweesak Malimas、Huong Thi Lan Vu、Pattaraporn Yukphan、Somboon Tanasupawat、Yamada, Yuzo

  • Tetrapisispora phaffii
  • Tetrapisispora blattae
  • Tetrapisispora namnaonensis
  • Nishimuraea gen. nov.
  • Nishimuraea blattae comb. nov.

  ダウンロード ：234 - 投稿日時:2023-03-21 12:55:55 UTC - 公開日時:2023-04-24 02:19:28 UTC - バージョン：3

  • PDF_ver.3 (English)

• The Subdivision of the Genus Eremothecium Borzi emend. Kurtzman (1995)

  Taweesak Malimas、Huong Thi Lan Vu、Pattaraporn Yukphan、Somboon Tanasupawat、Yamada, Yuzo

  • Crebrothecium ashbyi
  • Nematospora coryli
  • Eremothecium cymbalariae
  • Ashbya gossypii
  • Holleya sinecauda

  ダウンロード ：166 - 投稿日時:2023-02-12 11:46:05 UTC - 公開日時:2023-04-24 02:14:23 UTC - バージョン：2

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• The Subdivision of the Genus Kazachstania Zubkova sensu Kurtzman (2003) (Sacchromycetaceae)

  Taweesak Malimas、Huong Thi Lan Vu、Pattaraporn Yukphan、Somboon Tanasupawat、Yamada, Yuzo

  • Kazachstania viticola
  • Vanderwaltomyces africanus
  • Arxiozyma telluris
  • Neovaughania barnettii
  • Pachytichospora transvaarensis

  ダウンロード ：213 - 投稿日時:2023-03-16 11:05:43 UTC - 公開日時:2023-04-21 04:15:36 UTC - バージョン：3

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• Oncogenic stress-induced Netrin reprograms systemic metabolism as a humoral inter-organ molecule in Drosophila

  Okada, Morihiro 、Tomomi Takano、Yuko Ikegawa、Hanna Ciesielski、Hiroshi Nishida、Sa Kan Yoo

  • Netrin
  • oncogenic stress
  • inter-organ communication
  • Drosophila

  ダウンロード ：434 - 投稿日時:2022-07-07 09:46:46 UTC - 公開日時:2023-03-29 23:46:17 UTC - バージョン：2

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• SARS-CoV-2 HaploGraph: visualization of SARS-CoV-2 haplotypes spread in Japan

  Nakagawa, So、Katayama, Toshiaki、Jin, Lihua 、Wu, Jiaqi、Kryukov, Kirill 、Oyachi, Rise 、Junko S Takeuchi、Fujisawa, Takatomo 、Asano, Satomi 、Komatsu, Momoka 、Onami, Jun-ichi 、Abe, Takashi 、Arita, Masanori

  • COVID-19
  • haplotype
  • genomic surveillance
  • SARS-CoV-2
  • web visualization

  ダウンロード ：221 - 投稿日時:2023-03-22 08:46:03 UTC - 公開日時:2023-03-23 23:06:02 UTC

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• テンソル分解に基づく変数選択を用いたメラノーマの 1 細胞遺伝子発現プロファイルからの遺伝子選択

  松田, 信周、田口, 善弘

  • 機械学習
  • 癌

  ダウンロード ：235 - 投稿日時:2023-03-21 07:08:39 UTC - 公開日時:2023-03-23 08:22:36 UTC

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• The Generic Circumscription of Kazachstania Zubkova (1971) (Sacchromycetaceae) The Proposal of the New Genus Vanderwaltomyces

  Taweesak Malimas、Huong Thi Lan Vu、Pattaraporn Yukphan、Somboon Tanasupawat、Yamada, Yuzo

  • Kazachstania
  • Kazachstania viticola
  • Kluyveromyces
  • Vanderwaltomyces gen. nov
  • Vanderwaltomyces africanus comb. nov.

  ダウンロード ：131 - 投稿日時:2023-03-08 08:35:09 UTC - 公開日時:2023-03-13 01:04:11 UTC - バージョン：2

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• The Reinstatement of the Genus Kloeckeraspora Niehaus (1932) (Apiculate Yeast)

  Taweesak Malimas、Huong Thi Lan Vu、Pattaraporn Yukphan、Somboon Tanasupawat、Yamada, Yuzo

  • Kloeckeraspora osmophila
  • Kloeckerasora vineae
  • Kloeckeraspora occidentalis
  • Hanseniaspora valvyensis
  • Hanseniaspora uvarum

  ダウンロード ：147 - 投稿日時:2023-02-28 01:19:56 UTC - 公開日時:2023-03-13 00:35:06 UTC - バージョン：2

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• テンソル分解による妊娠時カドミウム曝露が代謝に与える影響の推定

  天藏, 悠基

  • 機械学習
  • 糖尿病

  ダウンロード ：168 - 投稿日時:2023-02-22 03:04:05 UTC - 公開日時:2023-03-07 08:50:45 UTC

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• The Generic Circumscription of Eremothecium emend. Kurtzman

  Yamada, Yuzo

  • Crebrothecium ashbyi
  • Nematospora coryli
  • Eremothecium cymbalariae
  • Ashbya gossypii
  • Holleya sinecauda

  ダウンロード ：156 - 投稿日時:2023-02-02 11:53:48 UTC - 公開日時:2023-02-20 02:21:40 UTC - バージョン：3

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• 家系生態学：ゲノム情報から近年の生態情報を抽出して希少種保全に貢献する

  秋田, 鉄也

  • 個体数推定
  • 近親標識再捕法
  • 親子判別

  ダウンロード ：426 - 投稿日時:2023-02-10 03:49:44 UTC - 公開日時:2023-02-13 08:27:09 UTC

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• Correlation analysis between time awareness and morningness-eveningness preference

  Sogawa, Reimi、Ono, Fuminori、Terao, Masahiko、Nagano, Shunta、Kawabe, Junko、Akashi, Makoto

  • time awareness
  • morningness-eveningness preference

  ダウンロード ：141 - 投稿日時:2023-02-08 11:21:19 UTC - 公開日時:2023-02-10 05:55:47 UTC

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• T2T時代の全ゲノム解析を支えるDNAシークエンス以外の要素： 核DNA分子のサイズ計測とクロマチン構造の捕捉

  工樂, 樹洋、西村, 理、門田, 満隆

  • ゲノム
  • ゲノムサイズ
  • クロマチン
  • Hi-C
  • C値

  ダウンロード ：871 - 投稿日時:2023-02-05 02:28:52 UTC - 公開日時:2023-02-06 10:41:02 UTC

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• ヒトタンパク質上のα-ヘリックス型膜貫通ドメインと天然変性領域は遺伝暗号表の配列の特性により遺伝子上の核酸組成の偏りとしてコードされている

  江角, 元史郎

  • 膜貫通ドメイン
  • 天然変性領域
  • 核酸組成
  • TA skew
  • GC含量
  • 遺伝暗号表
  • シャルガフの第2パリティ則

  ダウンロード ：223 - 投稿日時:2023-01-16 01:13:30 UTC - 公開日時:2023-01-23 08:45:46 UTC

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• The Generic Circumscription of Kockiozyma (Lipomycetaceae)

  Huong Thi Lan Vu、Pattaraporn Yukphan、Somboon Tanasupawat、Yuzo Yamada

  • Kockiozyma suomiensis
  • Myxozyma geophila
  • Kockiozyma geophila f.a.
  • Kockiozyma sirexii f.a.
  • Zygozyma oligophaga

  ダウンロード ：219 - 投稿日時:2022-11-20 06:51:27 UTC - 公開日時:2022-12-02 04:35:50 UTC - バージョン：2

  • PDF_ver.2 (English)

• The Revision of Lipomycetaceae

  Yamada, Yuzo、Huong Thi Lan Vu、Pattaraporn Yukphan、Somboon Tanasupawat

  • Waltomyces
  • Zygozyma
  • Babjevia
  • Smithiozyma
  • Kockiozyma

  ダウンロード ：505 - 投稿日時:2022-10-13 17:50:15 UTC - 公開日時:2022-11-28 02:12:47 UTC - バージョン：5

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• 建造環境における微生物叢の特徴と人体に及ぼす影響の理解に向けて

  伊藤, 光平

  • 建造環境
  • 微生物群集
  • 抗生剤耐性
  • 自己免疫疾患
  • 感染症

  ダウンロード ：628 - 投稿日時:2022-09-21 01:30:59 UTC - 公開日時:2022-11-15 04:29:21 UTC - バージョン：2

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• Chicken Cell Atlas: Science and DeSci

  Yamagata, Masahito

  • single-cell RNA sequencing
  • cell atlas
  • transcriptome
  • proteome
  • multimodal integration
  • decentralized science

  ダウンロード ：339 - 投稿日時:2022-10-06 03:31:49 UTC - 公開日時:2022-10-11 05:22:11 UTC

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• サリエンスをアフォーダンスとして捉え直す: 能動的推論の視点からの、精神病症状の異常サリエンス仮説への示唆

  吉田, 正俊、宮園, 健吾、西尾, 慶之、山下, 祐一、鈴木, 啓介

  • 統合失調症
  • 妄想
  • 視覚サリエンス
  • 動機サリエンス
  • 能動的推論
  • 自由エネルギー原理

  ダウンロード ：964 - 投稿日時:2022-08-28 08:15:01 UTC - 公開日時:2022-09-01 02:22:55 UTC

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• 膜貫通ドメイン合成支援は遺伝暗号表配列の重要な機能である

  江角, 元史郎

  • 遺伝暗号表
  • 膜貫通ドメイン
  • アミノ酸組成
  • 核酸組成
  • 主成分分析

  ダウンロード ：287 - 投稿日時:2022-08-12 00:47:57 UTC - 公開日時:2022-08-16 01:52:59 UTC

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• Collagens achieve highly biased amino acid composition not only by random mutation but also by slanted assignment of the genetic code table

  Esumi, Genshiro

  • collagen
  • amino acid composition
  • GC content
  • synonymous codon
  • genetic code table

  ダウンロード ：221 - 投稿日時:2022-08-01 00:51:09 UTC - 公開日時:2022-08-03 07:19:26 UTC

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• 必須アミノ酸の起源　細胞外マトリックス仮説

  江角, 元史郎

  • 必須アミノ酸
  • 起源
  • 細胞外マトリックス
  • 合成コスト
  • 細胞質

  ダウンロード ：454 - 投稿日時:2022-07-21 08:03:12 UTC - 公開日時:2022-07-25 09:43:33 UTC

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• Development of a direct duplex real-time PCR assay for rapid testing of domestic cat hepadnavirus

  Maya Shofa、Akiho Ohkawa、Tamaki Okabayashi、Yasuyuki Kaneko、Saito, Akatsuki

  • domestic cat hepadnavirus
  • direct duplex real-time PCR assay
  • rapid
  • sensitive

  ダウンロード ：313 - 投稿日時:2022-07-07 03:14:52 UTC - 公開日時:2022-07-07 08:55:49 UTC

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• Development of green fluorescent protein-based cAMP indicators with expanded dynamic range and various working ranges

  Sohei Hiasa、Takeru Fujimori、Saki Aiki、Hiroshi Ueda、Takashi Tsuboi、Kitaguchi, Tetsuya

  • biosensor
  • fluorescent protein
  • protein engineering
  • cyclic AMP
  • live-cell imaging
  • molecular evolution

  ダウンロード ：282 - 投稿日時:2022-06-30 07:04:18 UTC - 公開日時:2022-07-04 04:31:17 UTC

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• Synonymous codon usage and its bias in the bacterial proteomes primarily offset guanine and cytosine content variation to maintain optimal amino acid compositions

  Esumi, Genshiro

  • synonymous codon
  • codon usage bias
  • amino acid composition
  • GC content

  ダウンロード ：322 - 投稿日時:2022-06-26 21:06:34 UTC - 公開日時:2022-07-04 04:13:56 UTC - バージョン：2

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