加齢ゲノミクス研究における合計、相対、絶対分子発現量の間の関係性：シンプルな理論的考察

抄録

次世代シークエンサーを用いた研究の多くでは、mRNAなどの生体分子の発現を定量する際に、短いリードの総数を調整する正規化ステップが行われる。この前処理は、シーケンスされたリードの総数が異なる生物学的条件下で一定であるという仮定に基づいており、技術的なばらつきを除去するために実施される。そこで用いられるCount per millionのような正規化された発現値は相対的な発現値であり、絶対量の情報は失われている。しかしながら、加齢やがん研究においては、リードの総数が条件間で一定であるという仮定が成り立たないことが報告されている。本研究では、単純な理論解析に基づき、絶対量のlog fold-changeは、観測された相対量のlog fold-changeに総量のlog fold-changeを加えた値で表現できることを示す。本研究で提示するロジックは、オミックス研究におけるグローバルな変化とローカルな変化の関係に焦点を当てたものである。これは、相対存在量に基づくオミックス研究で差次的に発現した遺伝子が、絶対存在量の観点からどのように解釈されるべきかの簡単なチェックとして用いることができる。