T2T時代の全ゲノム解析を支えるDNAシークエンス以外の要素： 核DNA分子のサイズ計測とクロマチン構造の捕捉

抄録

DNAシークエンス技術の進歩により、水産育種や保全の対象となっている多様な生物種についても全ゲノム配列情報の取得が進められるようになり、その情報に基づいて集団遺伝構造を把握することや、実験動物ではアプローチできない生命現象を究める分子レベルの研究基盤を築くことが可能となった。ヒトでは、未決定領域をすべて解決したいわゆるT2T（telomere-to-telomere）グレードのゲノム情報が得られ、他のそれぞれの生物種においても、DNA配列を完全に読取ることを視野に入れてよい時代が到来した。そのための軸となるのが、ゲノムDNA分子を材料とするシークエンスやアセンブリであることは紛れもない事実だが、ゲノム情報の完成度について時代の流れとともに高まる要求を満たすためには、抽出したDNA以外の材料が重要な役割を果たす。配列を染色体規模に繋ぎ上げるためには、細胞核内のクロマチンに含まれるDNA分子の三次元構造の情報が多用されており、また、最終的に得られた配列情報の検証においては、細胞あたりの核DNA量、すなわちゲノムサイズとの照合が必要となるケースも少なくない。本稿では、とくにこの二点についてとくに技術的見地からの意義を議論し、筆者らによる独自の試みを紹介する。