ミトコンドリアDNA部分配列に基づく大阪府市街地において捕獲されたニホンジカの由来推定
DOI:
https://doi.org/10.51094/jxiv.5836キーワード:
アーバンディア、 都市の野生動物、 保全科学、 野生動物管理抄録
世界的に都市化が進み、野生動物と人間が都市空間を共有する機会が増え、それに伴う軋轢も顕在化している。このため、リスク低減に向けた都市管理や野生動物管理が必要である。日本列島のニホンジカは、江戸期から明治期の乱獲や大雪の影響で個体数が減少し、分布域が縮小した状態が保たれてきた。しかし、第二次世界大戦後のメスジカ禁猟政策に加え、林業の衰退や耕作放棄地の増加、気候変動などの複合的な要因によって、個体数増加と分布域の急速な再拡大が進んでいる。さらに近年、市街地に出没するシカ、いわゆるアーバンディアの事例も相次いでいる。2026年3月には大阪府の市街地にシカが出没し、捕獲後、府内の施設に保護された。当該個体は、市街地でも人を警戒しない様子であったため、奈良公園周辺に生息する個体が長距離移動した可能性が指摘された。本研究では大阪府市街地に出没したシカについてミトコンドリアDNAの部分配列を決定し、その出自を推定した。遺伝解析の結果、当該個体の遺伝子型はこれまで主に奈良公園を中心とした地域で確認されていたハプロタイプS4と一致した。この結果から、当該個体の母系統は、奈良市内に起源を持つ可能性が高いと言える。奈良市内からの長距離移動が生じた要因としては、奈良公園内における個体群密度の高まりが関与している可能性が高い。今回の事例のような個体の拡散を減らすためには、密度低下に向けた効果的な取り組みが求められる。
利益相反に関する開示
本研究は読売新聞社の助成を受けて実施された。ただし、資金提供者は研究計画、データ解析、結果の解釈および論文作成には一切関与していない。ダウンロード *前日までの集計結果を表示します
引用文献
Abe H, Kume T, Hyodo F, Oyamada M, Katayama A (2024) Soil erosion under forest hampers beech growth: Impacts of understory vegetation degradation by sika deer. Catena, 234, 107559. https://doi.org/10.1016/j.catena.2023.107559
Altschul SF, Madden TL, Schäffer AA, Zhang J, Zhang Z, Miller W, Lipman DJ (1997) Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs. Nucleic Acids Research, 25: 3389-3402. https://doi.org/10.1093/nar/25.17.3389
朝日新聞取材チーム (2024) 野生生物は「やさしさ」だけで守れるか? 命と向きあう現場から. 岩波書店, 東京.
Basak SM, Hossain MS, O'Mahony DT, Okarma H, Widera E, Wierzbowska IA (2022) Public perceptions and attitudes toward urban wildlife encounters–A decade of change. Science of the Total Environment, 834, 155603. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2022.155603
Booth AL, Ryan DA (2019) A tale of two cities, with bears: understanding attitudes towards urban bears in British Columbia, Canada. Urban Ecosystems, 22: 961-973. https://doi.org/10.1007/s11252-019-00873-7
Buteau RJ, Urbanek RE, Dumas C (2023) Perceived and desired outcomes of urban coyote management methods. Journal of Urban Ecology, 9: juad007. https://doi.org/10.1093/jue/juad007
Corcoran W, Fisher B (2022) Life with big cats: local perceptions of big cat species. Animal Conservation, 25: 467-479. https://doi.org/10.1111/acv.12756
Draheim MM, Parsons ECM, Crate SA, Rockwood LL (2019) Public perspectives on the management of urban coyotes. Journal of Urban Ecology, 5: juz003. https://doi.org/10.1093/jue/juz003
Finne KF, Dohrn N, Possfelt-Møller E, Penninga L (2026) Severe paediatric liver injury following a sika deer attack. BMJ Case Reports, 19: e270882. https://doi.org/10.1136/bcr-2025-270882
藤本 和義, 山口 昇 (1990) 奈良公園とその周辺地域のマダニ類の比較. 環動昆, 2: 133-137. https://doi.org/10.11257/jjeez.2.133
Heltai M (2013) Urban wildlife: conflict or coexistence?. Review on Agriculture and Rural Development, 2: 17-23.
広島県 (2024) イノシシ・シカ・サル・クマ 市街地出没対策マニュアル. https://www.pref.hiroshima.lg.jp/uploaded/attachment/594009.pdf (2026 年 7月30日確認)
北海道 (2015) アーバンディア対応マニュアル ー市街地に出没したエゾシカへの対応ー https://www.pref.hokkaido.lg.jp/ks/skn/est/ht/urbandeer.html (2026 年 7月30日確認)
Honda T, Iijima H, Tsuboi J, Uchida K (2018) A review of urban wildlife management from the animal personality perspective: the case of urban deer. Science of the Total Environment, 644: 576-582. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2018.06.335
Iijima H, Watari Y, Furukawa T, Okabe K (2022) Importance of host abundance and microhabitat in tick abundance. Journal of Medical Entomology, 59: 2110-2119. https://doi.org/10.1093/jme/tjac140
Iijima H, Ikeda T, Kubo MO, Takii A, Ando M (2025) Sika Deer Cervus nippon Temminck, 1836. In: Melletti M, Focardi S (eds), Deer of the World. Fascinating Life Sciences, 167-185. Springer, Cham. https://doi.org/10.1007/978-3-031-17756-9_9
Ikushima S, Torii H, Asano M, Suzuki M, Asai T (2021) Clonal spread of quinolone-resistant Escherichia coli among sika deer (Cervus nippon) inhabiting an urban city park in Japan. The Journal of Wildlife Diseases, 57: 172-177. https://doi.org/10.7589/JWD-D-19-00005
環境省 (2021) 全国のニホンジカ及びイノシシの個体数推定及び生息分布調査の結果について(令和 2 年度). https://www.env.go.jp/press/109239.html (2026 年 7月30日確認)
川口 竜助, 安藤 剛, 後藤 安宣 (2021) 奈良公園の鹿が関係した外傷症例49例の検討:記述疫学研究. 日本救急医学学会誌, 32: 543-548. https://doi.org/10.1002/jja2.12630
Keenan S, Niedziela D, Morera-Pujol V, Franklin D, Murphy KJ, Ciuti S, McMahon BJ (2024) Zoonotic disease classification in wildlife: a theoretical framework for researchers. Mammal Review, 54: 63-77. https://doi.org/10.1111/mam.12329
国際連合 (2025) 世界人口の45%が都市に居住、巨大都市の成長が続く 国連報告書が発表(2025年11月18日付). https://www.unic.or.jp/news_press/info/53356/ (2026 年 7月30日確認)
幸田良介. (2021). 迫りくる獣害問題: 大阪府における野生動物の生息状況と被害状況. 環動昆, 32(3), 137-142. https://doi.org/10.11257/jjeez.32.137
久保田 将之, 永田 純子, 新井 一司, 小西 清夏, 溝口 康. (2021) 東京都荒川河川敷において捕獲されたニホンジカのミトコンドリア DNA を用いた地域的な由来の推定. 森林防疫, 70: 3-6.
Matsumoto Y, Takagi T, Koda R, Tanave A, Yamashiro A, Tamate HB (2019) Evaluation of introgressive hybridization among Cervidae in Japan's Kinki District via two novel genetic markers developed from public NGS data. Ecology and Evolution, 9: 5605-5616. https://doi.org/10.1002/ece3.5131
McKinney ML (2008) Effects of urbanization on species richness: a review of plants and animals. Urban ecosystems, 11: 161-176. https://doi.org/10.1007/s11252-007-0045-4
Morosawa T, Iijima H, Kawamoto T, Kanno T, Araki R, Oka T (2026) Large ungulates will be present in most of Japan by 2050 owing to natural expansion and human population shrinkage. Scientific Reports, 16: 7550. https://doi.org/10.1038/s41598-026-38177-4
室賀 紀彦, 山本 健久 (2014) 口蹄疫ウイルスの感染と伝播. 獣医疫学雑誌, 18: 46-55. https://doi.org/10.2743/jve.18.46
Nabata D, Masuda R, Takahashi O, Nagata J (2004) Bottleneck effects on the sika deer Cervus nippon population in Hokkaido, revealed by ancient DNA analysis. Zoological Science 21: 473–481. https://doi.org/10.2108/zsj.21.473
長崎県 (2023) 野生動物が市街地等に出没したときの緊急対応マニュアル(ver2.1). https://www.pref.nagasaki.jp/uploads/2023/03/1679474359.pdf (2026 年 7月30日確認)
Nagata J, Masuda R, Kaji K, Kaneko M Yoshida MC (1998) Genetic variation and population structure of the Japanese sika deer (Cervus nippon) in Hokkaido Island, based on mitochondrial D-loop sequences. Molecular Ecology, 7: 871–877. https://doi.org/10.1046/j.1365-294x.1998.00404.x
Nagata J, Masuda R, Tamate HB, Hamasaki S, Ochiai K, Asada M, Tatsuzawa S, Suda K, Tado H, Yoshida MC (1999) Two genetically distinct lineages of the sika deer, Cervus nippon, in Japanese islands: comparison of mitochondrial D-loop region sequences. Molecular Phylogenetics and Evolution 13: 511–519. https://doi.org/10.1006/mpev.1999.0668
日本野生生物研究センター (1981) 第2回自然環境保全基礎調査 動物分布調査報告書(哺乳類) 全国版 (その2). https://www.biodic.go.jp/reports/2-6/ad000.html (2026 年 7月30日確認)
大泰司 紀之 (1986) ニホンジカにおける分類・分布・地理的変異の概要. 哺乳類科学, 53: 13-17. https://doi.org/10.11238/mammalianscience.26.2_13
大津町 (2024) 有害鳥獣における対応マニュアルhttps://www.town.ozu.kumamoto.jp/uploaded/attachment/12926.pdf
Oka T, Iijima H, Kamata A, Ishida A, Eguchi N, Aikawa T, Takahashi H, Kondoh H, Yayota C, Hayakawa M, Koizumi T (2022) The process of population expansion of sika deer. In K Kaji, H Uno, H Iijima, (Eds.), Sika deer: Life history plasticity and management. Ecological research monographs, 11–23. Springer. https://doi.org/10.1007/978-981-16-9554-4_2
坂井 明澄, 鳥居 春己 (2014) 奈良公園で死亡したニホンジカ Cervus nippon から採取したマダニ類について. 奈良教育大学自然環境教育センター紀要, 15: 27-34. http://hdl.handle.net/10105/9885
佐藤 真, 中村 一寛, 玉手 英利, 門脇 正史, 遠藤 好和, 高槻 成紀 (2013) 山形県で確認されたニホンジカ (Cervus nippon) の出自―ミトコンドリア DNA 多型に基づく推定―. 哺乳類科学, 53: 131-137. https://doi.org/10.11238/mammalianscience.53.131
佐藤 喜和 (2025) 生態系ネットワークの構築とヒグマの市街地侵入. 日本生態学会誌, 75: 41-58. https://doi.org/10.18960/seitai.2304
島根県 (2023) 中山間地域研究センター職員死亡事故に係る再発防止策について. https://www3.pref.shimane.jp/houdou/uploads/160721/142095/00090f2a91e6b173d9585f7e622c3c63.pdf (2026 年 7月30日確認)
Stinchcomb TR, Ma Z, Nyssa Z (2022) Complex human-deer interactions challenge conventional management approaches: the need to consider power, trust, and emotion. Ecology and Society, 27. https://doi.org/10.5751/ES-12899-270113
鈴木 正嗣 (2021) 学会発の注意喚起 「市街地に出没したイノシシへの対応方法につきまして」 を振り返って. ワイルドライフ・フォーラム, 26: 4-6. https://doi.org/10.20798/wildlifeforum.26.1_4
立木 靖之 (2015) 市街地に出没するヒグマ・エゾシカの状況と対応. 森林野生動物研究会誌, 40: 41-44. https://doi.org/10.20798/wildlifeforum.26.1_4
Takagi T, Matsumoto Y, Koda R, Tamate HB (2020) Bi-directional movement of deer between Tomogashima islands and the western part of the Kii Peninsula, Japan, with special reference to hybridization between the Japanese sika deer (Cervus nippon centralis) and the introduced exotic deer. Mammal study, 45: 133-141. https://doi.org/10.3106/ms2019-0048
Takagi T, Murakami R, Takano A, Torii H, Kaneko S, Tamate HB (2023) A historic religious sanctuary may have preserved ancestral genetics of Japanese sika deer (Cervus nippon). Journal of Mammalogy, 104: 303-315. https://doi.org/10.1093/jmammal/gyac120
Takagi T, Torii H, Kaneko S, Tamate HB (2024) The sacred deer conflict of management after a 1000-year history: Hunting in the name of conservation or loss of their genetic identity. Conservation Science and Practice, 6: e13084. https://doi.org/10.1111/csp2.13084
Torii H, Tatsuzawa S (2009) Sika deer in Nara Park: Unique human–wildlife relations. In McCullough DR, Takatsuki S, Kaji K, (Eds.), Sika deer: Biology and management of native and introduced populations, 347–363. Springer. https://doi.org/10.1007/978-4-431-09429-6_25
辻野 亮 (2024) 自動撮影カメラで確認された奈良教育大学自然環境教育センター奈良実習園に出没 したニホンジカの角切オス. 奈良教育大学自然環境教育センター紀要, 25: 1-8. http://hdl.handle.net/10105/0002000102
辻野 亮. (2026) カメラトラップ法で明らかにした高円山西斜面 (奈良市) における哺乳類相とオスジカの冬季の逸出. 奈良教育大学自然環境教育センター紀要, 27: 1-10. http://hdl.handle.net/10105/0002000393
Yamada M, Hosoi E, Tamate HB, Nagata J, Tatsuzawa S, Tado H, Ozawa S (2006) Distribution of two distinct lineages of sika deer (Cervus nippon) on Shikoku Island revealed by mitochondrial DNA analysis. Mammal Study, 31: 23-28. https://doi.org/10.3106/1348-6160(2006)31[23:DOTDLO]2.0.CO;2
山中 康彰, 辻野 亮, 鳥居 春己 (2021) 春日山原始林に生息するニホンジカの空間分布. 奈良教育大学自然環境教育センター紀要, 22: 11-20. https://doi.org/10.20636/00013471
吉川 博康, 藤原 利久, 瀬尾 浩和, 小山田 敏文, 小笠原 俊実, 椿 志郎, 斎藤 博, 佐藤 博, 吉川尭 (1994) 養鹿場における結核症の集団発生. 日本獣医師会雑誌, 47(6), 433-436. https://doi.org/10.12935/jvma1951.47.433
渡辺伸一 (2012) < 半野生> 動物の規定と捕獲をめぐる問題史-なぜ 「奈良のシカ」 の規定は二つあるのか?-. 奈良教育大学紀要 人文・社会科学, 61: 109-119. http://hdl.handle.net/10105/9044
渡辺伸一 (2017) 奈良のシカ保護管理の歩みとこれから―その社会学的検討―. 生物学史研究, 96: 35-52. https://doi.org/10.24708/seibutsugakushi.96.0_35
ダウンロード
公開済
投稿日時: 2026-07-30 12:16:11 UTC
公開日時: 2026-08-07 09:56:43 UTC
ライセンス
Copyright(c)2026
高木, 俊人
立澤, 史郎
永田, 純子
兼子, 伸吾
この作品は、Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International Licenseの下でライセンスされています。
