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片側カーネル主成分分析

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  • 山本, 博之 質量分析インフォマティクス研究会

DOI:

https://doi.org/10.51094/jxiv.262

キーワード:

主成分分析、 カーネル法、 メタボロミクス

抄録

主成分分析は,メタボロミクスをはじめとするオミックス研究において広く用いられている.カーネル主成分分析は,カーネル関数の設定次第で様々な非線形の主成分分析を計算出来ることから,機械学習においては広く用いられているが,オミックス研究においてはほとんど利用されていない.カーネル主成分分析がオミックスデータ解析に用いられてこなかったのは,カーネル主成分分析では主成分負荷量を直接計算することが出来ず,重要な変数を選び出せないことが理由の一つであると考えられる.そこで本研究では,主成分負荷量を計算可能なカーネル主成分分析として,片側カーネル主成分分析を提案する.

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引用文献

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Yamamoto, H. Journal of Chemometrics. 31(3) e2883 (2017).

Shen B. Cell. 182, 59-72. e15 (2020).

https://github.com/hiroyukiyamamoto/loadings

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投稿日時: 2023-01-31 12:55:05 UTC

公開日時: 2023-02-01 23:25:39 UTC

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研究分野
情報科学